Как сделать резервную копию сайта

Способ 1

У вас создан пользователь в ISPmanager которому принадлежит WWW домен. Зайдя с его паролем (пароль можно этот поменять в ISPmanager без проблем) по FTP можно скопировать файлы сайта. Что касается базы данных, то также можно перейти в PHPMyAdmin (ссылка в ISPmanager, как правило http://ip-address-vds/myadmin/ ) и сделать дамп через него.

Пароль используйте либо пароль пользователя от базы который устанавливается в ISPmanager в Базы данных (но следует понимать что если вы его поменяете (можно создать нового дополнительного пользователя), то тогда надо будет его поменять в конфиге сайта, иначе он перестанет работать), либо пароль MySQL root, его можно посмотреть в ISPmanager в меню Серверы баз данных.